草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿整体软件常用见的肠胃疾病中的一个。肾结构中CaOx多晶体过饱和状态积累会使得肾小管体细胞板材损害和凋亡，然而使得肾结石的出现。短链皮脂酸由肠胃内好氧菌细菌病毒面团发酵营养健康黏胶纤维发生，既在小面积的肠胃第一道防线中产生效果，而在整体软件能力上也产生至关重要效果。表中，丁酸是最极为丰富的短链皮脂酸，都具有免疫细胞可以抑制和免疫细胞可以抑制效果,本深入分析研究丁酸对CaOx肾结石的效果试述因素靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医阮泌尿整形科吴忠教援、周子健博士后于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教援、周子健搏士在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生态学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了无线网络药学学保障，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

优秀文章名号：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 客人组织：华山医院医生 探讨对象图片：大鼠、HK-2神经元 分组进行资料：照表组（Con）、三维模型组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱能提供水平：网路药理学学检则

构思流程步骤图

钻研结局

探索分析工作人员应当搭配大鼠建模，确认女性生理什么是生化因素和组识病理报告学染色剂等探索分析手法感觉丁酸能能缩短CaOx建模大鼠肾CaOx结晶体的转变成和直接挫裂伤，调理CaOx建模大鼠的宫颈炎症直接挫裂伤和空气氧化的材质的过激表现。不仅，丁酸还可抑制作用草酸诱导型的HK-2组织生殖细胞直接挫裂伤、空气氧化的应激反应和组织生殖细胞凋亡。 为探究性丁酸框架类型和靶DNA无线网路，论述人员管理从PubChem获得丁酸和丁酸酯的二维和二维框架类型（图1A）。按照PharmMapper大数据资料文件库和Uniprot大数据资料文件库解决后共需求出11八个丁酸靶DNA供进这一步概述。将DNA数据资料库导出STRING大数据资料文件库，实现PPI无线网路概述。Cytoscape给定了排顺的前20的核心站站靶DNA的相信无线网路图，也包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这样的核心站站DNA与无线网路中的的DNA均表面出固定的有观性，阐述这样的DNA机会激发着协作功用。GO和KEGG概述具体分析了丁酸核心站站DNA的有观方法和动物学工作（图1C）。核心站站DNA最主耍的与类固醇刺激起素回应、钝化应激性性回应、灵活力氧内部对类固醇刺激起素激起的发应及及对呈酸性检查是否材料的发应有观。与此同时所说，这样的核心站站DNA最主耍的参与活动了钝化应激性性和对灵活力氧的动物发应流程，是肾结石出现共识机制中至关主要的方法，这表面丁酸机会在肾结石中激发主要功用。

图1| 丁酸组成部分与靶什么是基因网络信息介绍(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进步打磨丁酸对CaOx肾结石事实上切靶dna遗传，调查考生合理利用GEO数据分析报告库对GSE73680中健康保健相较比较与CaOx肾结石自身的dna遗传不一致性来了调查。相较比较组与CaOx结石自身的强势性不一致性体现方式出dna遗传（DEGs）产前筛查原则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个dna遗传引发强势变化规律，在其中3379个（89.4%）dna遗传体现方式出上涨，404个（10.6%）dna遗传体现方式出降低（图2A）。对DEGs来聚类算法解析解析，热图表示了前10个被选中DEGs的二维等级聚类算法解析表现形式（图2B）。随着，调查考生实现GeneCards数据分析报告库人工费检测了370个有机会与CaOx肾结石涉及到的的dna遗传，排行前20位的分折dna遗传极其涉及到的性評分右图2C如下。从而选择丁酸的治疗CaOx肾结石的核心靶点，调查考生将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石涉及到的dna遗传补救能够 一个Venn图。最终能够，CYP2C9被选定为丁酸会影响CaOx肾结石的存在靶点(图2D)。再者，调查考生还来了丁酸与CYP2C9的碳原子衔接，CYP2C9的六个氨基残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸间接做用，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在应用微信网络药理学学预测分析CYP2C9是丁酸引响CaOx肾结石的靶基因组后，实验报告师还进行細胞实验报告否认了CYP2C9可降低了草酸引诱的HK-2細胞的ROS平行、细菌感染损坏和凋亡。

图2| 许多据库携手分折估计CYP2C9是丁酸效用于CaOx肾结石的靶dna

探究結果

本学习1察觉到丁酸在身体和内均能治理和改善CaOx肾结石整治的阳极氧化物应激反应性和细菌感染挫伤，接着可以确认网络数据上药剂学学学需求能够丁酸干扰CaOx肾结石的意向靶点——CYP2C9，结果可以确认神经元系实验设计声明CYP2C9在草酸盐引导的HK-2神经元系ROS层次、细菌感染挫伤和凋亡。这类察觉到体现了丁酸可以可以确认治理和改善CYP2C9来治理和改善CaOx肾结石的阳极氧化物应激反应性，减缓细菌感染挫伤。该过程中中拜谱海洋怪物提拱了网络数据上药剂学学学枝术的服务培训，不仅而且拜谱海洋怪物可提升成熟改善改善的什么是基因组学、球氨基酸组学、分泌组学等两组学类产品及枝术的服务培训，欢迎辞呼叫咨讯！ 参考价值学术论文：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.