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项目文章(Cancer Letters IF:10.1)|从糖代谢到表观遗传:肝癌进展的隐藏引擎

发布时间:2025-11-21
新陈受损细胞代谢转化重语言编程是癌肿出现和进展情况的图标,匍萄糖新陈受损细胞代谢转化的变更起着决定性目的。这般转为使癌肿体受损细胞能够短时间查看养分并呈现一定的新陈受损细胞代谢转化里面体,以此鼓励明显增强发育。虽然还具有决定性寓意,但癌肿体受损细胞上涨糖酵解的逻辑仍不够用了解一下。

近日,广州医学院专业首复属医院医生王学浩院士评选专业团体在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶向治疗人体脂肪分解代谢检测分析服务。

国外英文网站标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)

汉语主题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路

合作方行业:南京医科大学

探讨的材料:细胞

拜谱供给产品:转录组测序+淀粉酶互作组+靶向治疗体力排泄组

新技术路经:

的研究结局

01、YBX1被认定为HCC中糖酵解的关键点基因遗传

本科研搜集HCC恶性良性肉瘤样板(n=7)的单神经内部核RNA测序参数集参与概述,显示糖酵解几丁质酶具体集中点在恶性良性肉瘤神经内部核中,hdWGCNA概述分辨出9个DNA模块图片(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的环境概述确实YBX1为自由环境的风险方面(图1H)。进第一步结合实际IHC、WB试验和恶性良性肉瘤组织化机构与靠近非恶性良性肉瘤组织化机构的办公空间转录组学参数集声明YBX1是肝神经内部核癌疗法的暗藏靶点(图1I-K)。

图1:YBX1被判定为调HCC细胞核糖酵解的要点缘由

02、YBX1可以淡化HCC中的有氧糖酵解和增值

为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向疗法卡路里分解组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。

图2:YBX1可以淡化HCC中的有氧糖酵解和繁殖

03、OGT与YBX1结合起来并力促YBX1的O-GlcNAc糖基化

为了识别YBX1的调控因子,蛋清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。

图3:OGT与YBX1构建并有利于YBX1的O-GlcNAc糖基化

04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增加其磷过酸,而使得其核转位

进这十步查测YBX1的O-GlcNAc糖基化是不是引响其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC神经组织细胞中或用OGT减弱剂OSMI-1工作,YBX1核蛋清质水准可观降低了,YBX1磷硝化作用可观缩减(图4A-C)。IP实验设计表示,在完全相同的Flag-YBX1底物水准下,YBX1-WT的磷硝化作用水准可观少于YBX1-T57A,体现了磷硝化作用的增大不单单仅是正因为会高的YBX1核蛋清质理解(图4D)。区分了核和质类物质发觉TMG工作的HCC神经组织细胞中YBX1核理解的增加(图4E-F),进这十步发觉YBX1磷硝化作用的重要性调控细胞因子是AKT(图4G-I)。以下发觉透露O-GlcNAc糖基化按照提高其磷硝化作用来提升YBX1核蛋清质不稳相关性性并提高核转位。

图 4.YBX1的 O-GlcNAc 绘制有好处于其进的一步发现磷硝化作用绘制并能够增进其核转位

05、YBX1利于PKM2转录

前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。

图 5.YBX1有利于PKM2转录

06、YBX1 会改善组蛋白质乳酸性反应装饰总体水平

研究探讨遇到YBX1敲低有效减小了核蛋清质含量乳碱化,特别的是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解调节剂2-DG的试验验证了糖酵解与组核蛋清乳碱化的直观同步,调节糖酵解可有效减小了H3K18la质量(图6D)。PKM2过描述可逆转转YBX1敲低引起的H3K18la下调,以外源乳酸处置实际上加强H3K18la,还引起YBX1描述调整,警告存在着正向着反馈意见(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR验证,H3K18la依据生物富集于YBX1启动的子直观有助于其转录,该整个过程受O-GlcNAc糖基化调空(图6H-J),并遇到P300 调整是YBX1增強H3K18乳酰化成用的机理(图6K-L)。

图6.YBX1增进H3K18乳硝化作用装饰质量

论文个人心得体会

在任何深入分析中通讯稿了YBX1在HCC中高表达方法爱,和与糖酵解迷切涉及到的。YBX1在T57处被O-GlcNAc遮盖,为了平稳球球蛋白并加剧其表达方法爱。这般遮盖还使得YBX1在T57处的磷过酸,使得其核易位。由于,这操作过程增强学习了糖酵解涉及到的什么是什么是基因的转录并的刺激乳酸的行成。与此同时,YBX1激活码P300的转录,必将驱动安装组球球蛋白的乳过酸,很是H3K18la,H3K18乳过酸顺向控制YBX1什么是什么是基因转录(图7)。

图7.Y糖酵解-表观遗传病双面馈环共识机制图

拜谱个人心得体会

本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱微生物为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶向疗法能量是什么分解组技术服务,拜谱生物体建立了完善成熟的转录组学、蛋白酶组学、当地翻译后突显组学、基础代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!

借鉴文章

Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.
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